Накладные расходы. Поштучно...

[Vals]

Навскидку, не вдаваясь в подробности:
Накладные в заголовке закупке задаются с целью их последующего распределения на строки
Распределение на количество и на строки.


.
Если вы хотите ввести накладныве на каждую номенклатуру отдельно -воспользуйтесь Строки/Настройки/Накладные расходы.

Цитата:

При настройке автоматического начисления расходов по закупке при использовании нужного кода и при выборе категории "поштучно" операция обрабатывается корректно

потому что она формируется для строк, а не для заголовковзакупки.