Одновременный учет несколькими пользователями

[mazzy]

Да, именно так.

Уменьшайте время блокировки данных.
Либо программно, либо увеличивая мощность железа.

Для Аксапты методика повышения производительности описана здесь
http://axapta.mazzy.ru/lib/querytuning/
http://axapta.mazzy.ru/lib/mssqlsetup2/
http://axapta.mazzy.ru/lib/adjustment/
http://axapta.mazzy.ru/lib/dbgrowthsolution/

Для Навижина похоже, но есть особенности.
Во-первых, разберитесь с узкими местами (снимите данные счетчиков), во-вторых, разберитесь с индексами. В Навижине многие индексы можно выключить, много чего включить дополнительно. Но включать/выключать индексы можно только на основании данных измерения производительности.