Помогите разобраться с производством.

[Starling]

К сожалению, производство под рукой нет, чтобы проверить. Но по-моему решение такой задачи один в один стандартный функционал не предполагает.
Думаю в вашем случае можно попробовать настроить версии спецификации:
1. Версии1 – списание из Цеха1
2. Версия 2 – списание их Цеха 2
3. ….
При создании строк заказа на продажу указывать в поле «Версия спецификация», нужную вам версию в зависимости от того, с какого скала будет выполняться продажа и списание. По идеи при создании производственного заказа будет использоваться именно эта версия, и соответственно склад списания будет корректно определяться.