На мой взгляд не совсем корректное утверждение. В 2009 проводки ГК по журналу переноса создаются при смене сайтов, в случае переноса из одного профиля в другой в рамках одного сайта проводки ГК не генерятся.
В 2012 по идее должно быть аналогично.
В 2009 при перемещении между профилями учета система формирует бух проводки, если для этих профилей учета настроены разные счета. Не путайте людей.
Вот например ссылка: