В стандарте невозможно.
Для каждой накладной по заказу создается одна проводка по клиенту и одна проводка в ГК (Дт 62 Кт 90). Именно поэтому аналитика берется из шапки заказа.
Возможные варианты: создавать вручную несколько заказов с разными аналитиками в шапке, либо модифицировать разноску накладной заказа, чтобы на лету формировалось несколько накладных в разрезе аналитик строк заказа (сомнительный геморрой в плане реализации и последствий).
Думаю, что оба варианта вас не устроят