Создаете отдельное приложение - туда все переносите на нужный слой, компилируете. Далее через это приложение подключаетесь к исходной базе, потом надо будет провести реиндексацию, проверку/синхронизацию и удалить старые (со старыми идентификаторами) записи из таблицы SqlDictionary.
Гарантий целостности данных не даю
