Поинтересуйтесь оборудованием и софтом, поставляемыми компанией "Пилот" (
www.pilot.ru, не сочтите за рекламу). У них, кстати, есть представители в Сибири.
Их кассовый модуль "Профи-Т", на мой взгляд, один из лучших в своем классе. Имеет модульную архитектуру, открытый API и массу плагинов для работы с внешними системами и периферией, включая терминалы. С внешним миром общается через текстовые файлы, создаваемые по настраиваемым шаблонам.
Интересующую Вас свертку по наименованиям/ценам продажи можно легко написать в Навижине, тем более, что он у Вас давно и спецы, стало быть, есть.
А ситуации типа "Товар есть в кассе и нет в Системе" - решаются в первую очередь организационно и, в принципе, права на жизнь не имеют, также как и "пустые" товары в кассе.