Ну, тогда плясать от печки
Как в АХ вообще идет учет по сотрудникам?
Подотчетные денежки, начисление зп и тп
Вот туда тогда и сливать накопленной в комиссии в CommissionTrans специальной периодической операцией.
Раньше, до появления типа счета подотчетник всех сотрудников для учета вели в клиентах или поставщиках в спец группе Сотрудники. И по ним ЖКГ делали нужные проводки.
Соотв. по учету все было видно все равно и на нужном счете плана счетов.
Итого, функционал комиссий есть штатный
Нужно его изучить и сделать для Закупок по аналогии + нужное. Как это отражать в учете - так же, как это отражается уже сейчас (или это совсем другой вопрос
)