Я давно не пользовал печатные формы АХ, тем более С-Ф
Но помнится, что она смотрит на галку уже в накладной
См. метод
\Data Dictionary\Tables\CustInvoiceJour\Methods\initFromCustInvoiceTable
там должно быть
this.InclTax = _custInvoiceTable.InclTax_PL;
Если есть и не пашет, то с-ф тогда лезет в первоисточник, а так как галка эта польская, то предполагаю, что на нашу С-ф ей плевать.
Соотв, этого кода просто нет