Так можно разделить используя расширенную функциональность управления складом - со всеми вытекающими отсюдова последствиями, в виде использования приемок и отгрузок, настройки пользователей, как сотрудников склада, и т.д.
Уж лучше програмировать чем использовать стандартные "Расширенный подбор и размещение" ИМХО