Добавил секции на закладку Поля.
Код начала секции исправил на СекцияДокумент.
В файле клиент-банка оставил один документ. Все равно нет результата, попробую полезть в отладчик и разбираться на месте.

Причем вот какая есть особенность в файле: в нем приходит выписка по нескольким документам.
Примерно так:
СекцияДокумент=Мемориальный ордер
...
КонецДокумента
СекцияДокумент=Платежное поручение
...
КонецДокумента

Секция в электронном формате должна быть все равно СекцияДокумент?