Ну, во-первых, если в закупке не ставить партию, она генерится автоматически (создается новая в зависимости от настроек Группы складской аналитики в модуле "Управление запасами"), а ,если поставить, то добавляет проводки в выбранную партию.
В расходе (заказы,журналы), если не проставлять партию в строках, берется N доступных партий, где есть остатки, и 1 запись со статусом "заказано", если товара на складе не хватило. (Могут быть варианты при разных настройках резервирования товара).
Кроме того, если в настройках Управление запасами\Настройки \Разное в поле "Автоматическое добавление" не стоит галочка, то при корректировке количества по строке заказа в большую сторону, например, с 3 на 5, добавится строка проводок с количеством 2, а не исправится 3 на 5.
Далее, при обработке частичных продаж (немедленная поставка) по строке заказа, каждая строка в InvnetTrans может делится на несколько строк и т.д. и т.п.