У меня такое бывало при работе через USB клавиатуру после прерывания исполнения по Ctrl-Break.
Если используется PS/2 клавиатура то все ок.
Обычно помогает многократное нажатие Ctrl-Break или Ctrl-C.
см. также
Вы уверены, что хотите отменить эту операцию?