Поделить на строки и заголовки, преобразовать склады в InventDimId, сохранить в CSV с помощью OpenOffice, загрузить в 2 приема с помощью функции импорта.
ИЛИ
Установить Data Export Import Framework, подключиться к файлу черезе ODBC и заимпортировать (см.
http://blogs.msdn.com/b/dynamics-coe...migration.aspx).