Таблички Batch* достаточно проблемные, гарантированного универсального решения, по крайней мере у меня нет. В качестве путей решения могу предложить:
1. Переиндексация. Смотреть DBCC SHOWCONTIG по каждому индексу, обычно они в безобразном состоянии, т.к. многие записи динамически создаются/удаляются.
2. Если блокируется именно вся таблица (я честно говоря сомневаюсь в этом, но чем черт не шутит) - смотрим
Отключение эскалации блокировок в MSSQL 2008
3. Если происходит эскалация блокировки с записи до страницы (тоже неприятно), то можно отключить это в индексе(ах).
4. Не плохо бы посмотреть на наличие "сторонних" вмешательств в механизмы пакетных заданий в АХ
5. А может блокировка не на табличках Batch* ?