Угу - делал нечто похожее. Точнее написал job, который по сессии профайлера генерит текстовый файл, который, в свою очередь, подается на вход Graphviz.
Наиболее времязатратные участки выделял толщиной линий; методы, выполняющиеся меньше какого-то предельного порога, не выводились.