Насколько мне известно, функции удаленной установки Аксапты нет. Так что, выход - написать подробную инструкцию для пользователей, какие кнопочки жать в инсталляторе клиентской части. Чаще всего просто Enter
Можно облегчить процесс конфигурирования, положив файл конфигурации (myConfig.xpo) в общедоступную сетевую папку. А в ярлыке запуска Аксапты указать через пробел параметр - файл конфигурации.