В 1С код справочника "склады" числовой, а у контрагентов - текстовый.
Excel работает с Variant.
На худой конец, попробуй и в аксапте использовать variant (хотя это тяжелое и грубое решение). Наверное стоит разобраться с типами.
ЗЫ На самом деле все коды в 1С - текстовые. Но в зависимости от галочки 1С их по разному интерпретирует. Особенно через КОМ