[belugin]

Я бы тут заменил "Runtime" на "DesignTime" .

    var runtimeProviderConfiguration = New Microsoft.Dynamics.AX.Metadata.Storage.**Runtime.Runtime**ProviderConfiguration(packageDir);
    var metadataProviderFactory =  New Microsoft.Dynamics.AX.Metadata.Storage.MetadataProviderFactory();
    Microsoft.Dynamics.AX.Metadata.Providers.IMetadataProvider provider = metadataProviderFactory.Create**Runtime**Provider(runtimeProviderConfiguration);

Честно говоря,не знаю в чем дело, но если бы я писал систему, я бы рантаймовую метадату максимально облегчил от груза дизайнтаймовых свойств.