сегодня поймал на 2009 версии - такой косяк:
1. импортируем файл из банка
2. под клиентские платежи создаётся общий журнал
3. не зависимо от параметров модуля Расчеты с клиентами - в строке общего журнал ставится Тип сопоставления = Нет.
4. результат - клиент/банк и автосопоставление по клиенту вещи не совместимые. Ну точнее докодить слегка нужно