Настраиваются шаблоны пополнения и директивы пополнения в зону комплектации. Например, можно настроить чтобы туда перемещались целые паллеты или определенные кванты товара. А директивы комплектации уже будут брать не из ячеек хранения, а из зоны комплектации.
https://technet.microsoft.com/en-us/.../dn750873.aspx
Аналогично можно настроить пополнение и в старом WMS.